В третьей части статьи, посвященной истории Элладской Церкви во время и после Второй мировой войны, затрагивает вопросы религиозной политики властей в итальянской зоне оккупации Греции, о попытках итальянцев ослабить национальное самосознание греческого населения, о преследованиях духовенства и еврейского населения страны, о борьбе Элладской Церкви за жизнь греческих евреев и о разделениях и переменах внутри Церкви, а также рассматривает ее взаимоотношения с Московским Патриархатом.

С началом Второй мировой войны положение Элладской Православной Церкви становится противоречивым. Религиозная политика оккупационных властей на Балканах не предвещает ничего хорошего. ­Враждебность греческого населения к немецким оккупантам продолжает расти, в то время как некоторые иерархи открыто поддерживают захватчиков. Однако в 1941 г. Восточная Македония и Западная Фракия переходят под болгарскую юрисдикцию. Начинается активная болгаризация оккупированных земель. Болгарская Церковь проводит политику, направленную на распространение своей юрисдикции на всех занятых территориях. Во второй части статьи М.В. Шкаровского подробно описывается тяжелая участь, выпавшая на долю Элладской Церкви в военный период в немецкой, а затем болгарской зоне оккупации.

После проигранной войны с Турцией в Греции происходит военный переворот, премьер-министр казнен, король – свергнут с престола. На фоне этих печальных событий ситуация в Элладской Церкви складывается непростая. Календарная реформа вызывает жестокие гонения на старостильников, возникает раскол. За этим следует Вторая мировая война, усугубившая разделение внутри Церкви. Первая часть статьи доктора исторических наук М.В. Шкаровского посвящена истории многострадальной Элладской Православной Церкви начиная с 1833 года и до первых лет войны.